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`!SABIO-RK`! (`!S`!ystem for the `!A`!nalysis of `!Bio`!chemical Pathways – `!R`!eaction `!K`!inetics) ist eine web-zugängliche `F33f`_`[Datenbank`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Datenbank]`_`f, welche umfassende Informationen über `F33f`_`[biochemische Reaktionen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Chemische_Reaktion]`_`f und ihre `F33f`_`[kinetischen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Kinetik_(Chemie)]`_`f Eigenschaften speichert.`:cite-ref-1[`F5bf`_`[1`#cite-note-1]`_`f]`:cite-ref-2[`F5bf`_`[2`#cite-note-2]`_`f]`:cite-ref-3[`F5bf`_`[3`#cite-note-3]`_`f]`:cite-ref-4[`F5bf`_`[4`#cite-note-4]`_`f]`:cite-ref-5[`F5bf`_`[5`#cite-note-5]`_`f]

Im Gegensatz zu anderen Datenbanken, welche entweder als Enzymdatenbank (`F33f`_`[BRENDA`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=BRENDA]`_`f) oder Proteindatenbank (`F33f`_`[UniProt`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=UniProt]`_`f) oder Modelldatenbank (BioModels, JWS Online) angelegt sind, repräsentiert SABIO-RK eine Reaktions-orientierte Datenbank mit quantitativen Informationen zur Reaktionsdynamik.

Die Dynamik biochemischer Reaktionen ist von zentraler Bedeutung in `F33f`_`[Biologie`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Biologie]`_`f und `F33f`_`[Medizin`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Medizin]`_`f für das Verständnis zellulärer Vorgänge und bei der Entwicklung von Medikamenten. Die experimentell erhaltenen Daten zur quantitativen Beschreibung von Reaktionsdynamik und `F33f`_`[Enzymkinetik`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Enzymkinetik]`_`f werden manuell aus der Literatur extrahiert und in standardisierter Form in SABIO-RK gespeichert. Der Inhalt der Datenbank umfasst kinetische `F33f`_`[Parameter`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Parameter_(Mathematik)]`_`f in Bezug auf biochemische Reaktionen und ihre biologischen Quellen. Darüber hinaus werden kinetische Geschwindigkeitsraten von `F33f`_`[Enzymen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Enzyme]`_`f und die entsprechenden Gleichungen sowie die zugehörigen experimentellen Bedingungen gespeichert. Alle Daten werden von biologischen Experten manuell kuratiert und kommentiert, unterstützt durch automatisierte Konsistenzprüfungen. Auf SABIO-RK kann über web-basierte Benutzeroberflächen oder automatisch über Web Services zugegriffen werden. Beide Schnittstellen unterstützen den Export der Daten zusammen mit entsprechenden `F33f`_`[Annotationen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Annotation]`_`f in `F33f`_`[SBML (Systems Biology Markup Language)`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Systems_Biology_Markup_Language]`_`f, beispielsweise für den Import in Modellierungs-Werkzeugen. SABIO-RK wird am `F33f`_`[Heidelberger Institut für Theoretische Studien (HITS)`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Heidelberger_Institut_für_Theoretische_Studien]`_`f gepflegt und weiter entwickelt.

Gegenwärtig sind in SABIO-RK etwa 71.000 einzelne kinetische Datensätze gespeichert, welche aus über 7.300 Publikationen stammen`:cite-ref-6[`F5bf`_`[6`#cite-note-6]`_`f] (Stand Oktober 2021). Annotationen erfolgen zu einer Reihe weiterer Datenbanken, darunter `F33f`_`[KEGG`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Kyoto_Encyclopedia_of_Genes_and_Genomes]`_`f, `F33f`_`[ChEBI`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=ChEBI]`_`f, `F33f`_`[PubChem`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=PubChem]`_`f, `F33f`_`[UniProt`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=UniProt]`_`f, `F33f`_`[NCBI`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=National_Center_for_Biotechnology_Information]`_`f, `F33f`_`[Reactome`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Reactome]`_`f, `F33f`_`[BRENDA`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=BRENDA]`_`f, MetaCyc, BioModels, und `F33f`_`[PubMed`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=PubMed]`_`f.

>>Contents

• `F0af`_`[Zugang zu SABIO-RK`#zugang-zu-sabio-rk]`_`f

• `F0af`_`[Weblinks`#weblinks]`_`f

• `F0af`_`[Einzelnachweise`#einzelnachweise]`_`f

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>>Zugang zu SABIO-RK

Für akademische und nicht-kommerzielle Nutzer ist die Nutzung von SABIO-RK kostenlos. Kommerzielle Nutzer benötigen eine Lizenz. Die gespeicherten Daten sind auf verschiedenen Wegen abrufbar:

• Web-basiert (Browser): die Datenbank lässt sich mit verschiedenen Kriterien nach kinetischen Daten durchsuchen. Zu diesen Kriterien zählen u. a. die Suche nach `F33f`_`[Substraten`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Substrat_(Biochemie)]`_`f, Produkten, `F33f`_`[Coenzymen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Kofaktor_(Biochemie)]`_`f, `F33f`_`[Inhibitoren`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Inhibitor]`_`f, `F33f`_`[Enzymnamen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Enzym]`_`f, `F33f`_`[EC-Nummern`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=EC-Nummer]`_`f, `F33f`_`[Geweben`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Gewebe_(Biologie)]`_`f, `F33f`_`[Organismen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Organismus]`_`f, `F33f`_`[Publikationen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Publikation]`_`f, `F33f`_`[kinetischen Parametertypen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Enzymkinetik]`_`f, `F33f`_`[zellulärer Lokalisationen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Zelle_(Biologie)]`_`f oder `F33f`_`[Stoffwechselwegen`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Stoffwechselweg]`_`f.

• Daneben werden Webservices zur Verfügung gestellt, welche die kinetischen Informationen auf automatisierte Anfrage weiterleiten (`F33f`_`[REST`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Representational_State_Transfer]`_`f-konforme Schnittstellen).

>>Weblinks

• Offizielle SABIO-RK Webseite

>>Einzelnachweise

`:cite-note-1`!1.`! `F0af`_`[↑`#cite-ref-1]`_`f U. Wittig, M. Rey, A. Weidemann, R. Kania, W. Müller: SABIO-RK: an updated resource for manually curated biochemical reaction kinetics. In: Nucleic Acids Research. Band 46, D1, 4. Januar 2018, S. D656–D660, `F33f`_`[doi`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Digital_Object_Identifier]`_`f:10.1093/nar/gkx1065, PMID 29092055.

`:cite-note-2`!2.`! `F0af`_`[↑`#cite-ref-2]`_`f U. Wittig, R. Kania, M. Golebiewski, M. Rey, L. Shi, L. Jong, E. Algaa, A. Weidemann, H. Sauer-Danzwith, S. Mir, O. Krebs, M. Bittkowski, E. Wetsch, I. Rojas, W. Müller: SABIO-RK--database for biochemical reaction kinetics. In: Nucleic Acids Research. Band 40, Database issue, Januar 2012, S. D790–6, `F33f`_`[doi`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Digital_Object_Identifier]`_`f:10.1093/nar/gkr1046, PMID 22102587.

`:cite-note-3`!3.`! `F0af`_`[↑`#cite-ref-3]`_`f I. Rojas, M. Golebiewski, R. Kania, O. Krebs, S. Mir, A. Weidemann, U. Wittig: Storing and annotating of kinetic data. In: In Silico Biology. Band 7, 2 Suppl, 2007, S. 37–44, PMID 17822389.

`:cite-note-4`!4.`! `F0af`_`[↑`#cite-ref-4]`_`f Ulrike Wittig, Martin Golebiewski, Renate Kania, Olga Krebs, Saqib Mir, Andreas Weidemann, Stefanie Anstein, Jasmin Saric, Isabel Rojas: Data Integration in the Life Sciences (= Lecture Notes in Computer Science. Band 4075). 2006, ISBN 3-540-36593-1, SABIO-RK: Integration and Curation of Reaction Kinetics Data, S. 94–103, `F33f`_`[doi`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Digital_Object_Identifier]`_`f:10.1007/11799511_9.

`:cite-note-5`!5.`! `F0af`_`[↑`#cite-ref-5]`_`f Wolfgang Müller: `*Datengetriebene Wissenschaft: Pfade im Informationsdschungel.`* In: `*`F33f`_`[Spektrum der Wissenschaft`:/page/entry.mu`zim=wikipedia_de_all_nopic_2026-01.zim|entry_path=Spektrum_der_Wissenschaft]`_`f.`* Dezember 2011. Auf Spektrum.de (PDF; 554,16 kB), abgerufen am 12. Mai 2022.

`:cite-note-6`!6.`! `F0af`_`[↑`#cite-ref-6]`_`f Statistics of SABIO-Reaction Kinetics Database Status: 2021-10 abgerufen am 16. Oktober 2021.

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